Namun, novel ini juga memiliki beberapa kelemahan, seperti terlalu banyak tokoh dan cerita sampingan, terlalu banyak halaman dan tebal, dan terlalu banyak koin kebetulan. Novel ini juga terkadang terasa berlebihan dan tidak realistis. Novel ini mungkin tidak cocok bagi pembaca yang menyukai novel yang ringan, sederhana, dan logis.
Secara keseluruhan, novel Perahu Kertas adalah novel yang layak untuk dibaca, terutama bagi pembaca yang menyukai novel romantis, inspiratif, dan kreatif. Novel ini juga dapat menjadi salah satu karya sastra Indonesia yang patut dibanggakan.
